一、不用专用清洗剂 清洗溶液随意配
由于自动清洗机的循环、喷淋等作用，普通的清洗剂含有表面活性剂，会形成大量的泡沫。这些泡沫一方面会溢出来，另一方面也有可能导致循环泵的损坏，所以自动清洗机只能使用无泡沫或低泡沫的清洗剂。
专用的清洗剂不仅含有碱或酸，还有螯合剂、络合剂等多种活性物质。通过这些活性物质的协同作用更好地溶解和分散残留物。此外，清洗溶液不仅要有去除残留物的清洗能力，还不能损坏设备的表面和管路。设备厂商在推荐清洗剂时，都经过细致的测试与评估，确认满足各方面的条件才可以使用。
自己配制，由于不了解设备的材料特性，很容易导致设备损坏，将会得不偿失。选择稳定高质量的专用清洗剂，不仅能够最大限度的发挥设备的潜力，延长设备的使用寿命，还能很大程度的确保清洗工艺的稳定性和可重复性。
二、洗瓶机坚固耐用 不注意定期保养
洗瓶机由于需要频繁的接触酸和碱，需要对各种化学物质有一定的耐受性，通常选择高性能的不锈钢材料制作。尽管如此，定期对设备进行保养仍然是必须的。这样可以确保设备随时处于可用状态，延长设备的使用寿命。
有些频繁转动的部件，如蠕动泵及其软管、循环泵等需要定期进行检查和更换配件，以确保清洗剂可以按照设定的数值正常吸入，设备正常运转。长期停机不用也有可能会导致某些阀门失效或者杂质堵塞管道等。保养工作可以由内部的设备工程师完成，也可以外包给设备厂商完成。对自动清洗机进行定期的保养，有利于长期的、高效的使用设备，发挥设备的最大价值。
三、洗瓶机功能强大 玻璃器皿都能洗
洗瓶机可以一次性、大批量地清洗相同/相近规格的玻璃器皿，如大型自动洗瓶机可以一次清洗几十个容量瓶或几百只培养皿。由于实验室玻璃器皿有不同的结构、尺寸和容量，如果能够将玻璃器皿进行适当的分类，选配合适的装置支架，这样便能够很大程度地发挥洗瓶机的强大清洗能力。
如果残留物中含有遇热会凝固的蛋白质，使用自动清洗机时需要特别小心。须在室温下先将蛋白质清洗干净后方可进行加热清洗。但仍然存在蛋白质凝固后粘附在设备内表面或器件表面的可能性，清理起来非常麻烦。类似的情况还有非常粘附的聚合物等。在这种情况下，适当的预处理可能是必须的。另外，有些形状复杂或者细小的器皿或零部件，使用其它的清洗方式可能效果会更好。
受制于清洗设备和水基清洗剂适用范围的限制，某些水基清洗剂无法湿润、渗透或溶解的难溶性残留物，例如某些试验需要用到强氧化性酸高温消解样品时残留的复杂的难溶物，无法通过自动清洗机清洗干净。
四、洗瓶机操作简单 使用无须受培训
随着自动控制技术和编程技术的不断发展，自动清洗机的控制系统越来越智能化，人机界面越来越友好。自动清洗机的操作变得简单起来，有时只是需要按下电源开关就可以完成一整套包括从预清洗到烘干的清洗任务。
但是，自动清洗机毕竟是一台复杂的电气设备，如何使用、维护和保养需要进行专门的培训以确保设备和操作人员的安全。大部分自动清洗机都带有编程功能，可以根据清洗的对象和残留物类型，设置不同的清洗和冲洗程序，以及调节清洗温度和清洗时间等参数。操作人员如果接受了专业培训，就可以根据自己的实际情况通过追踪记录所有的清洗参数。持续不断的优化工艺条件，以提高清洗效率和减少清洗剂的消耗。
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